合同协议书和专用合同的用途、内容、解释均有所差异，如果合同协议书与专用条款内容产生冲突的话，那么专用条款的效力优先。更多关于合同协议书和专用条款的区别的相关知识，接下来小编就为您来解答这个疑惑。
一、合同协议书和专用条款的区别
1、用途不同：专用条款是对一般条款的具体化、补充或修改。这是一个必要的补充条款，不能缺少。否则，公路行业的通用条款和准专用合同条款将不完善。
通用条款是根据法律、行政法规和建设工程的需要制定的，在建设工程中通用。
2、内容不同：承包商认为需要进一步规定的，或根据当地特点或做法需要增加或删除的规定，如优质工程奖励条款、承包商人员规定、设备不到位时处理违约的规定，也列在特殊合同条款。
3、解释不同：特殊条款的解释顺序优于一般条款。只有经双方特别约定，才具有法律效力，否则不能作为和解的依据。
项目专用合同的条款在通用合同条款和公路行业专用合同的标准条款中有规定。项目专用条款数据表是合同条款和条件的组成部分，如异常气候条件，应在专用条款或数据表中予以规定。
一般条款是同一版本所有施工合同的共同内容。专用条款是指合同当事人就本合同项下的工程或项目所订立的与本通用条款不同或对本通用条款作了修改的专用协议。
二、合同协议书和专用条款谁有优先效力
一般来说专用条款优先于通过用条款和协议书，除非双方另有约定。
《合同法》第一百二十五条合同解释
当事人对合同条款的理解有争议的，应当按照合同所使用的词句、合同的有关条款、合同的目的、交易习惯以及诚实信用原则，确定该条款的真实意思。合同文本采用两种以上文字订立并约定具有同等效力的，对各文本使用的词句推定具有相同含义。各文本使用的词句不一致的，应当根据合同的目的予以解释。
三、什么是专用条款
专用条款：是发包人与承包人根据法律、行政法规规定，结合具体工程实际，经协商达成一致意见的条款，是对通用条款的具体化、补充或修改。
项目专用合同条款是在通用合同条款和公路行业标准专用合同条款中明确指出要在专用条款或数据表中予以具体规定的数据、信息或与工程所在地具体情况有关的规定（如异常气候条件），是必备的配套条款，不能缺少，否则通用条款和公路行业准专用合同条款就不完善。项目专用条款数据表是合同条款的组成部分。
发包人认为需要进一步具体化的条款，或根据本地区特点或惯例需增列或删除的条款，例如优质工程的奖励条款、承包人人员、设备不到位时的违约处理办法条款等，也在本篇列出。
小编温馨提示：合同必须是在当事人真实意思表示下做出的。以上内容就是小编为你整理的关于合同协议书和专用条款的区别的相关知识，希望在工作和学习中能够帮助到您。如果您有其他问题感到疑惑，欢迎咨询律师。